Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo47A2A6H3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo47A2A6H3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo47A2A6H3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo47A2A6H3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fbxo47A2A6H3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms