Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCZ6

1700016G14Rik, RIKEN cDNA 1700016G14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700016G14RikA0A286YCZ6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700016G14RikA0A286YCZ6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700016G14RikA0A286YCZ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700016G14RikA0A286YCZ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.3 ms