Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCQ6

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YCQ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A286YCQ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A286YCQ6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A286YCQ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A286YCQ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A286YCQ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A286YCQ6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A286YCQ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A286YCQ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A286YCQ6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms