Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVP8

Gm5580, Predicted pseudogene 5580, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5580A0A0N4SVP8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm5580A0A0N4SVP8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm5580A0A0N4SVP8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm5580A0A0N4SVP8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm5580A0A0N4SVP8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5580A0A0N4SVP8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms