Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWI4

2310009B15Rik, RIKEN cDNA 2310009B15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
2310009B15RikA0A0A6YWI4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.6 ms