Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B020011L13RikA0A087WQI7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms