RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 P4HTMQ9NXG6 502 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 NDOR1Q9UHB4 597 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 SRPK3Q9UPE1 567 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CDYLQ9Y232 598 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa24.03■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CELSR2Q9HCU4 2923 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 A1L4Q6 167 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 CBX6O95503 412 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 AP2A1O95782 977 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 NR6A1Q15406 480 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 NAPRTQ6XQN6 538 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM5Q9C035 493 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 TXLNGQ9NUQ3 528 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 ASF1BQ9NVP2 202 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRF-216ENST00000617451 WIPF3A6NGB9 483 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 OR51F1A6NGY5 319 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL41O60662 606 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 FOXN2P32314 431 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 SOX8P57073 446 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 KIR2DS3Q14952 304 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 SLC5A12Q1EHB4 618 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 P3H1Q32P28 736 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 TTC13Q8NBP0 860 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 PLAGL1Q9UM63 463 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 PLCL2Q9UPR0 1127 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD12Q6UB98 2062 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC78A2IDD5 438 aa24■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC162PA2VCL2 907 aa24■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 SOWAHDA6NJG2 315 aa24■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 PSMD3O43242 534 aa24■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 UMODP07911 640 aa24■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 ATXN8OSP0DMR3 200 aa24■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC9A5Q14940 896 aa24■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 SYTL3Q4VX76 610 aa24■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 NDC1Q9BTX1 674 aa24■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 LACRTQ9GZZ8 138 aa24■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 ISM1B1AKI9 464 aa23.99■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 OR56A5P0C7T3 313 aa23.99■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 TMEM151BQ8IW70 566 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 PANX2Q96RD6 677 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A11Q9NSA0 550 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 IRAK4Q9NWZ3 460 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 CREBBPQ92793 2442 aa23.99■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 GCGRP47871 477 aa23.98■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 CCDC38Q502W7 563 aa23.98■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 LINC00523Q86TU6 105 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 TM9SF4Q92544 642 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 INPP5DQ92835 1189 aa23.98■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 TMEM121Q9BTD3 319 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 EURLQ9NYK6 297 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 OR1I1O60431 355 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 LDLRP01130 860 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 CYP2A13Q16696 494 aa23.97■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZS92 163 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 FAM20CQ8IXL6 584 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 ZADH2Q8N4Q0 377 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
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PTPRF-216ENST00000617451 RANBP9Q96S59 729 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
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