RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609525.1

CSNK2A1-208, Transcript of casein kinase 2 alpha 1, human

TSL 5

Gene CSNK2A1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	FAR2	Q96K12	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ASB7	Q9H672	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSME4	Q14997	1843 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525		A8MUI8	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NCAM2	O15394	837 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSMD3	O43242	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	STBD1	O95210	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VCL	P18206	1134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CD58	P19256	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSMA2	P25787	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ARRB2	P32121	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PEX19	P40855	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ELK3	P41970	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAGEA3	P43357	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	PSMD8	P48556	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	VPS41	P49754	854 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NUMB	P49757	651 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NR1H2	P55055	460 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	P2RX3	P56373	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	NAA20	P61599	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAB1A	P62820	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TMED1	Q13445	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	BIRC2	Q13490	618 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	RAB32	Q13637	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	DPYS	Q14117	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSNK2A1-208	ENST00000609525	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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