RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 MMP20O60882 483 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CEACAM4O75871 244 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 NUDT17P0C025 328 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ERVK-10P10266 1014 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 LHCGRP22888 699 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 MC4RP32245 332 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 MSH2P43246 934 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 SPINT3P49223 89 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 BLKP51451 505 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PFN3P60673 137 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 RPS21P63220 83 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PPARDQ03181 441 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PTSQ03393 145 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 RALGDSQ12967 914 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 SGCGQ13326 291 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ITGA9Q13797 1035 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PTPRRQ15256 657 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CRB2Q5IJ48 1285 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 DCAF10Q5QP82 559 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 LGSNQ5TDP6 509 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 NEPROQ6NW34 567 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 LRIG3Q6UXM1 1119 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM151BQ6UXP7 276 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 RPTNQ6XPR3 784 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 LRRC6Q86X45 466 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PPM1NQ8N819 430 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 BMPERQ8N8U9 685 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 OR13J1Q8NGT2 312 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 OR4L1Q8NH43 312 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 NUS1Q96E22 293 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA16Q9BXB7 569 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM83DQ9H4H8 585 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CATSPERZQ9NTU4 200 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 MOCS1Q9NZB8 636 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CRLS1Q9UJA2 301 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ADAM21Q9UKJ8 722 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.29□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A0U1RQS6 177 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 TLDC2A0PJX2 215 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 H7C0S8 307 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 C19orf84I3L1E1 186 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CCL22O00626 93 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 E2F3O00716 465 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 RASGRF2O14827 1237 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ZW10O43264 779 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 B4GAT1O43505 415 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP8B1O43520 1251 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PRAMEF1O95521 474 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PYGLP06737 847 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 INHBBP09529 407 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CTSEP14091 401 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 EDN3P14138 238 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 DCDC1P59894 354 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ACVR1Q04771 509 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CACNG1Q06432 222 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 PTPRCAPQ14761 206 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 TCEA2Q15560 299 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 KRT71Q3SY84 523 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CEP85LQ5SZL2 805 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF470Q6ECI4 717 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 OR4D9Q8NGE8 314 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ULK4Q96C45 1275 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 AP2M1Q96CW1 435 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ZIM3Q96PE6 472 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 FUT8Q9BYC5 575 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ASB8Q9H765 288 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 VPS18Q9P253 973 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 CD84Q9UIB8 345 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 TLN2Q9Y4G6 2542 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-209ENST00000590049 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.27□□□□□ -0.61
CAPNS1-209ENST00000590049 ARGFXA6NJG6 315 aa11.27□□□□□ -0.61
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM159BA6NKW6 160 aa11.27□□□□□ -0.61
CAPNS1-209ENST00000590049 SMIM23A6NLE4 172 aa11.27□□□□□ -0.61
CAPNS1-209ENST00000590049 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms