RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589537.1

NFIC-208, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 2

Gene NFIC, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-208ENST00000589537 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.06■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 IQCF5A8MTL0 148 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 ISM1B1AKI9 464 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 J3QKU1 62 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 MEN1O00255 615 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 TMEM63AO94886 807 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 S1PR4O95977 384 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 RAB40ALP0C0E4 278 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 ABRQ12979 859 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 DSELQ8IZU8 1212 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 KRT222Q8N1A0 295 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 OR1L3Q8NH93 324 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 THAP4Q8WY91 577 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 LPGAT1Q92604 370 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 MR1Q95460 341 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 SERPINB12Q96P63 405 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 ACTL8Q9H568 366 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 NEU2Q9Y3R4 380 aa16.05■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 SLC28A2O43868 658 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 TPBGLP0DKB5 382 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 PVRP15151 417 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CD9P21926 228 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 RORAP35398 523 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 GPS2Q13227 327 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 ERV3-1Q14264 604 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 UGT8Q16880 541 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 NEPROQ6NW34 567 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 VRK3Q8IV63 474 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 PPIL6Q8IXY8 311 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 COG1Q8WTW3 980 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 BIRC8Q96P09 236 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.04■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CDC14CA4D256 554 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 RASGRF2O14827 1237 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 AVILO75366 819 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 USP1O94782 785 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 AGXTP21549 392 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 MAGEA3P43357 314 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 TERF1P54274 439 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 PPP1R7Q15435 360 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CES3Q6UWW8 571 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 ATG14Q6ZNE5 492 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 TMEM135Q86UB9 458 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CALML6Q8TD86 181 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 RNF31Q96EP0 1072 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 NRTNQ99748 197 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 MENTQ9BUN1 341 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 NLNQ9BYT8 704 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CHST8Q9H2A9 424 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 PCMTD2Q9NV79 361 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 PLAGL1Q9UM63 463 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 PLCL2Q9UPR0 1127 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 SPTA1P02549 2419 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 C9J4A7 227 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 E5RI56 91 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 MKRN2OSH3BPM6 223 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 ZNF749O43361 778 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 RFPL1O75677 317 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 OR2B3O76000 313 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CD63P08962 238 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CHRM3P20309 590 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 FMO4P31512 558 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 PMS2P54278 862 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 GBX1Q14549 363 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 NAA25Q14CX7 972 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 TTLL9Q3SXZ7 439 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 CTSL3PQ5NE16 218 aa16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NFIC-208ENST00000589537 PCGF5Q86SE9 256 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms