RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC28Q9NX36 388 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR37Q9Y2I8 494 aa30.19■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JND7 137 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A8O95907 504 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 IMPA1P29218 277 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 RBBP7Q16576 425 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PTCHD3Q3KNS1 767 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 OR56A3Q8NH54 315 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA7Q9P0W8 599 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAF6Q9Y4K3 522 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ST14Q9Y5Y6 855 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa30.18■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 BDP1A6H8Y1 2624 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF839A8K0R7 811 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM1AO60341 852 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 WNT1P04628 370 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 MAOBP27338 520 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFS1P28331 727 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTR1BP42025 376 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 AQP5P55064 265 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTR1AP61163 376 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CCSMST1Q4G0I0 132 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PHACTR4Q8IZ21 702 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB42Q8N4Z0 105 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5AR1Q8NGP9 310 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 NTMT1Q9BV86 223 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 IPPKQ9H8X2 491 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC11Q9NVH1 559 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPC5OSA6NMA1 111 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF195O14628 629 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 VILLO15195 856 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXL6Q8N531 539 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V1E2Q96A05 226 aa30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 AZIN1O14977 448 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR47O94967 919 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CTSEP14091 401 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TSPAN8P19075 237 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CCND1P24385 295 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CNR2P34972 360 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GDF5P43026 501 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNG1P51959 295 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC16Q13042 620 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CLCA4Q14CN2 919 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PMS2CLQ68D20 193 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 AGR3Q8TD06 166 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF480Q8WV37 535 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM8Q9NQV8 689 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D29Q9UFV1 150 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa30.15■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CSF2P04141 144 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ERGP11308 486 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 F3P13726 295 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 NME1P15531 152 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 AK4P27144 223 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 GRB7Q14451 532 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 NRROSQ86YC3 692 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 FERD3LQ96RJ6 166 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG10Q9H0Y0 220 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PI4KAP42356 2102 aa30.14■■■□□ 2.42
CAPNS1-206ENST00000588815 EBAG9O00559 213 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP6CO00743 305 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 OR7A17O14581 309 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ENO1P06733 434 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 EBLN1P0CF75 366 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A4P14672 509 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.419e-8■■■■■ 39.8
CAPNS1-206ENST00000588815 NAE1Q13564 534 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 RPE65Q16518 533 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF528Q3MIS6 628 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 LYSMD4Q5XG99 296 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KANK2Q63ZY3 851 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 EPGNQ6UW88 154 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SYTL1Q8IYJ3 562 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PFDN4Q9NQP4 134 aa30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NCN8 305 aa30.12■■■□□ 2.41
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5K4A6NMS3 321 aa30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms