RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 APOLD1Q96LR9 279 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ATOH8Q96SQ7 321 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CDC6Q99741 560 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 EGFL8Q99944 293 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 HGH1Q9BTY7 390 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 RDH14Q9HBH5 336 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PARVBQ9HBI1 364 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 POT1Q9NUX5 634 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ARL15Q9NXU5 204 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 POLG2Q9UHN1 485 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 MID2Q9UJV3 735 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 EMCNQ9ULC0 261 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PDE10AQ9Y233 779 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 OARD1Q9Y530 152 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 U3KQA8 63 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 TARM1B6A8C7 271 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 UBXN8O00124 270 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 MYO1CO00159 1063 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 TNFSF14O43557 240 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 NOBOXO60393 691 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SMIM24O75264 130 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 GUCA1CO95843 209 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PROCP04070 461 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ANXA5P08758 320 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 TPBGLP0DKB5 382 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 MYL2P10916 166 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 GFAPP14136 432 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CKMT2P17540 419 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SLC19A1P41440 591 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 BDKRB1P46663 353 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 FASLGP48023 281 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 HNMTP50135 292 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PPP2R2AP63151 447 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 DAB2P98082 770 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CDKL1Q00532 357 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 HHEXQ03014 270 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PRKG2Q13237 762 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 MPP2Q14168 576 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PLCL1Q15111 1095 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 GLRX5Q86SX6 157 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ARL10Q8N8L6 244 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 KYQ8NBH2 561 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 GPR156Q8NFN8 814 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 MGARPQ8TDB4 240 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PATE1Q8WXA2 126 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ATL1Q8WXF7 558 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC126Q96EE4 140 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC138Q96M89 665 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CD274Q9NZQ7 290 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 COPG2Q9UBF2 871 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 TMCO1Q9UM00 188 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms