RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
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CTDNEP1-202ENST00000570380 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.819e-8■■□□□ 13.7
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
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CTDNEP1-202ENST00000570380 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.815e-8■■■■□ 19.7
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CTDNEP1-202ENST00000570380 CHRNA4P43681 627 aa9.97□□□□□ -0.81
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CTDNEP1-202ENST00000570380 AP1B1Q10567 949 aa9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
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