RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 SPAG6O75602 509 aa20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 F7P08709 466 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 PPP1CAP62136 330 aa20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 TRADDQ15628 312 aa20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 BROXQ5VW32 411 aa20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 CD200R1Q8TD46 325 aa20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 MED16Q9Y2X0 877 aa20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 NFS1Q9Y697 457 aa20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 ESYT3A0FGR9 886 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 ISM1B1AKI9 464 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 STMND1H3BQB6 276 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZBTB14O43829 449 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 TPBGLP0DKB5 382 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 LIPCP11150 499 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 PKLRP30613 574 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 SSTR1P30872 391 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 HSD17B2P37059 387 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 ANKS6Q68DC2 871 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 SPESP1Q6UW49 350 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 D2HGDHQ8N465 521 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 GPATCH11Q8N954 259 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR6C1Q96RD1 312 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 NDNQ99608 321 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF839A8K0R7 811 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 CUL1Q13616 776 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR8K5Q8NH50 307 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 IFT81Q8WYA0 676 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC30A3Q99726 388 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 FANCEQ9HB96 536 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 FOXJ2Q9P0K8 574 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 RARRES3Q9UL19 164 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 BTRCQ9Y297 605 aa20.33■□□□□ 0.85
ADAMTS17-205ENST00000558960 APC2O95996 2303 aa20.33■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 KLK10O43240 276 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 FKBP9O95302 570 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 FGF5P12034 268 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 UGT2B7P16662 529 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 MCM3P25205 808 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 STX2P32856 288 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 ABCG1P45844 678 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 BDKRB1P46663 353 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 UCNP55089 124 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 SH3BP2P78314 561 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 GRB7Q14451 532 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 MYO1HQ8N1T3 1032 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 ASB11Q8WXH4 323 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 VPS39Q96JC1 886 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR2A14Q96R47 310 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 CTRCQ99895 268 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 A0A0J9YY10 115 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATP1A2P50993 1020 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 IL2P60568 153 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 TUBB4BP68371 445 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 TUBB3Q13509 450 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 ARHGAP19Q14CB8 494 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS17-205ENST00000558960 TCTN2Q96GX1 697 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms