RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	MPP3	Q13368	585 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PPP1R7	Q15435	360 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	SLC1A5	Q15758	541 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	P3H1	Q32P28	736 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	BCL7A	Q4VC05	210 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CCDC38	Q502W7	563 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FCRL6	Q6DN72	434 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ZNF398	Q8TD17	642 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	NAT14	Q8WUY8	206 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	LCN9	Q8WX39	176 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	VPS50	Q96JG6	964 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	RANBP9	Q96S59	729 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	KRT12	Q99456	494 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	VAT1	Q99536	393 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ARL5A	Q9Y689	179 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GSAP	A4D1B5	854 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CFAP99	D6REC4	459 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	AGPS	O00116	658 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TTI1	O43156	1089 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	LRRTM2	O43300	516 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	LDB2	O43679	373 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	BANF1	O75531	89 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	OR2B3	O76000	313 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ANXA9	O76027	345 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	POLB	P06746	335 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	APRT	P07741	180 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	EDN3	P14138	238 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CA5A	P35218	305 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PAFAH1B1	P43034	410 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CD151	P48509	253 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CRADD	P78560	199 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	RAPSN	Q13702	412 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	POU6F1	Q14863	301 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CYP2A13	Q16696	494 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PARP6	Q2NL67	630 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	MLIP	Q5VWP3	458 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CUZD1	Q86UP6	607 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	HOOK3	Q86VS8	718 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	KCNMB4	Q86W47	210 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	HM13	Q8TCT9	377 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FAR1	Q8WVX9	515 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	ULK4	Q96C45	1275 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PPM1M	Q96MI6	270 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	PWWP2A	Q96N64	755 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CS-233	ENST00000552688	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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