RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 WLSQ5T9L3 541 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PMS2CLQ68D20 193 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 C18orf63Q68DL7 685 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 KCTD11Q693B1 232 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CLEC6AQ6EIG7 209 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SASS6Q6UVJ0 657 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 DLEU7Q6UYE1 221 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 AACSQ86V21 672 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SERINC5Q86VE9 423 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PAQR7Q86WK9 346 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 KATNAL2Q8IYT4 538 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CPXM2Q8N436 756 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 D2HGDHQ8N465 521 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 L3MBTL4Q8NA19 623 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CLEC1AQ8NC01 280 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TRPV3Q8NET8 790 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 OR9K2Q8NGE7 335 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CDC26Q8NHZ8 85 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 OCC1Q8TAD7 63 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ATL1Q8WXF7 558 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MCRS1Q96EZ8 462 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 LURAP1Q96LR2 239 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 WDR92Q96MX6 357 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 BTBD9Q96Q07 612 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NPAS1Q99742 590 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SOX7Q9BT81 388 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ALG12Q9BV10 488 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 HAPLN2Q9GZV7 340 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NUAK2Q9H093 628 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SPATC1LQ9H0A9 340 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FZD8Q9H461 694 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TOR3AQ9H497 397 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RGCCQ9H4X1 137 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM231Q9H6L2 316 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RIOX1Q9H6W3 641 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 KIF9Q9HAQ2 790 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 KLHL1Q9NR64 748 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA1456Q9P272 454 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RHCGQ9UBD6 479 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 HESX1Q9UBX0 185 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 POLLQ9UGP5 575 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB21Q9UL25 225 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNK6Q9Y257 313 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.46□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 UTYO14607 1347 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MAST3O60307 1309 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MACROD2A1Z1Q3 448 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC34A8MYJ7 566 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SNAP23O00161 211 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD28O15084 1053 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NKX2-8O15522 239 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP27B1O15528 508 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RRP8O43159 456 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NDUFS4O43181 175 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ACSL4O60488 711 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SELENOFO60613 162 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ATG13O75143 517 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CDH16O75309 829 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 HAUS5O94927 633 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CALCAP01258 141 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 LCATP04180 440 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 HIST1H2ABP04908 130 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SBK3P0C264 359 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 IQCF3P0C7M6 154 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 GYPEP15421 78 aa3.45□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 HIST1H2ADP20671 130 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms