RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	OXTR	P30559	389 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	GDF5	P43026	501 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	GBX1	Q14549	363 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	PDGFRL	Q15198	375 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	VIT	Q6UXI7	678 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	IFNE	Q86WN2	208 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	CD244	Q9BZW8	370 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	WWOX	Q9NZC7	414 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	MAP10	Q9P2G4	905 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		15.33	■□□□□ 0.05
GRSF1-208	ENST00000545193	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	RFXAP	O00287	272 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	MT-ND1	P03886	318 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	PRR35	P0CG20	571 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF284	Q2VY69	593 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	GPR141	Q7Z602	305 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ANKFN1	Q8N957	763 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	METTL6	Q8TCB7	284 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	CYGB	Q8WWM9	190 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	FBXL20	Q96IG2	436 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	REV3L	O60673	3130 aa		15.33	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	OTC	P00480	354 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	CAPN1	P07384	714 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	MSH3	P20585	1137 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	CAPN3	P20807	821 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF234	Q14588	700 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ACOX1	Q15067	660 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	OGFOD2	Q6N063	350 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	VRK3	Q8IV63	474 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	MIER2	Q8N344	545 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	OR2T11	Q8NH01	316 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ISOC1	Q96CN7	298 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	OPTC	Q9UBM4	332 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	DHRS12	A0PJE2	317 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	SGTA	O43765	313 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	NUAK1	O60285	661 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	KATNA1	O75449	491 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	15.32	■□□□□ 0.04	2e-6	■□□□□ 8.6
GRSF1-208	ENST00000545193	TFPT	P0C1Z6	253 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	BMP2	P12643	396 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	RPIA	P49247	311 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAF3	Q13114	568 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	TERB1	Q8NA31	727 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	TMIE	Q8NEW7	156 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	TIFA	Q96CG3	184 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ADI1	Q9BV57	179 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	MSRA	Q9UJ68	235 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	PDE10A	Q9Y233	779 aa		15.32	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC01565	O15544	149 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	IDO1	P14902	403 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	DIO3	P55073	304 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	AP2M1	Q96CW1	435 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM245	Q9H330	911 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	CDH7	Q9ULB5	785 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193		V9GYQ6	96 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	OR2AG2	A6NM03	316 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	WNT9A	O14904	365 aa		15.31	■□□□□ 0.04
GRSF1-208	ENST00000545193	SPINT1	O43278	529 aa		15.31	■□□□□ 0.04

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