RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 STIP1P31948 543 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 GRIA1P42261 906 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SSPNQ14714 243 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SLC9A5Q14940 896 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 KYNUQ16719 465 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A19Q695T7 634 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 HPS6Q86YV9 775 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TMEM139Q8IV31 216 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC22Q8N4W6 341 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 HES6Q96HZ4 224 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ZNF778Q96MU6 729 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 IRAK4Q9NWZ3 460 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CDYLQ9Y232 598 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SEC16AO15027 2179 aa16.31■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 KDM1AO60341 852 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
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HERC3-211ENST00000513325 CCR7P32248 378 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 FOLR3P41439 243 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 FOXL2P58012 376 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 KIR2DS3Q14952 304 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ZNF534Q76KX8 674 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 VRK3Q8IV63 474 aa16.3■□□□□ 0.2
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HERC3-211ENST00000513325 OR4L1Q8NH43 312 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 IP6K3Q96PC2 410 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 RANBP9Q96S59 729 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TTC1Q99614 292 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 AP1M1Q9BXS5 423 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 MAP10Q9P2G4 905 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.3■□□□□ 0.2
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HERC3-211ENST00000513325 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.3■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 E7EVH7 732 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 F8W8V4 182 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 LIASO43766 372 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SUN1O94901 812 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ETS1P14921 441 aa16.29■□□□□ 0.2
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HERC3-211ENST00000513325 ADRA1DP25100 572 aa16.29■□□□□ 0.2
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HERC3-211ENST00000513325 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.29■□□□□ 0.2
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HERC3-211ENST00000513325 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TMEM151BQ8IW70 566 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 OR2Y1Q8NGV0 311 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 NDC1Q9BTX1 674 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 EURLQ9NYK6 297 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 RIMKLBQ9ULI2 386 aa16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.29■□□□□ 0.2
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HERC3-211ENST00000513325 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 IQCF5A8MTL0 148 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 MASP2O00187 686 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PEX12O00623 359 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SEMA7AO75326 666 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CD63P08962 238 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PKLRP30613 574 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 RAB28P51157 221 aa16.28■□□□□ 0.2
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HERC3-211ENST00000513325 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 C4orf17Q53FE4 359 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
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HERC3-211ENST00000513325 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TXLNBQ8N3L3 684 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 GALNT16Q8N428 558 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.28■□□□□ 0.2
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