RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507692.5

SNHG4-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 5

Gene SNHG4, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-205	ENST00000507692	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CNST	Q6PJW8	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SPESP1	Q6UW49	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CTRC	Q99895	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	XKR8	Q9H6D3	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	LHX6	Q9UPM6	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692		A0A0J9YY10	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TP73	O15350	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RAD1	O60671	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SPAG6	O75602	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	STK17B	O94768	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	HAUS5	O94927	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FKBP9	O95302	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MATN4	O95460	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	C1orf105	O95561	183 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	AHSG	P02765	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MT-ND3	P03897	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CBSL	P0DN79	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FGF5	P12034	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FOLR1	P15328	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	UGT2B7	P16662	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CD9	P21926	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PKLR	P30613	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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