RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482195.5

DDX39B-220, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 1,232 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-220ENST00000482195 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 CUZD1Q86UP6 607 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 INPP5DQ92835 1189 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 GBP5Q96PP8 586 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 CITED4Q96RK1 184 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 VAT1Q99536 393 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 COPS8Q99627 209 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 GBA3Q9H227 469 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 OSGIN2Q9Y236 505 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 NTNG1Q9Y2I2 539 aa9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 SYCE3A1L190 88 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 WIPF3A6NGB9 483 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 LRRTM2O43300 516 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 PSTPIP1O43586 416 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 SGTAO43765 313 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ANXA9O76027 345 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 CRTAMO95727 393 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 MSL3P1P0C860 447 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 UGT2B7P16662 529 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 PDHA2P29803 388 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 MC4RP32245 332 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 HIF1AQ16665 826 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 SYTL3Q4VX76 610 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 SNX20Q7Z614 316 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 NXPE1Q8N323 547 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 OR2Y1Q8NGV0 311 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.826e-6■□□□□ 9.8
DDX39B-220ENST00000482195 MOCOSQ96EN8 888 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 CDC23Q9UJX2 597 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 PLAGL1Q9UM63 463 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ICKQ9UPZ9 632 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 CSAG2Q9Y5P2 127 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.95□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 A0A0J9YY10 115 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 C5orf60A6NFR6 353 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 HACD1B0YJ81 288 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 CD63P08962 238 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 TPM1P09493 284 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ALAS2P22557 587 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 PSMB4P28070 264 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 RBL1P28749 1068 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 SHMT2P34897 504 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 XIAPP98170 497 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 CDC16Q13042 620 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 PRPSAP1Q14558 356 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 BRD3Q15059 726 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 PTERQ96BW5 349 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 CCDC42Q96M95 316 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 NDC1Q9BTX1 674 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 GOLPH3Q9H4A6 298 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 FAM60AQ9NP50 221 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.94□□□□□ -0.82
DDX39B-220ENST00000482195 ASF1AQ9Y294 204 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms