RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 BBS2Q9BXC9 721 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 KLQ9UEF7 1012 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 AURKCQ9UQB9 309 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 NOTCH4Q99466 2003 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 INPP4BO15327 924 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 SLCO2B1O94956 709 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 FTH1P02794 183 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 TYRP14679 529 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 GSTT1P30711 240 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 PBX2P40425 430 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 CLDN8P56748 225 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 C21orf58P58505 322 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 UBE3AQ05086 875 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ARHGEF7Q14155 803 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 GK3PQ14409 553 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 TEAD2Q15562 447 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 DPPA4Q7L190 304 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 NSMCE2Q96MF7 247 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 TMEM74Q96NL1 305 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 GUCD1Q96NT3 240 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 DPY30Q9C005 99 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 PIDD1Q9HB75 910 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 OLAHQ9NV23 265 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ARL15Q9NXU5 204 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 SLC8A2Q9UPR5 921 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 SGTAO43765 313 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ANXA6P08133 673 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF23P17027 643 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2ADP20671 130 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 GDF5P43026 501 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 OR4D2P58180 307 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ATG9BQ674R7 924 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 GLYATQ6IB77 296 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 SATL1Q86VE3 508 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 LIX1Q8N485 282 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 CBR4Q8N4T8 237 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 CHST14Q8NCH0 376 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 FAM110BQ8TC76 370 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF583Q96ND8 569 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ACPTQ9BZG2 426 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF576Q9H609 170 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 DMTF1Q9Y222 760 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ARHGAP10A1A4S6 786 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 UPK3BL1B0FP48 263 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 UPK3BL2E5RIL1 263 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 PSMD11O00231 422 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ERN1O75460 977 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ASLP04424 464 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 GSTM1P09488 218 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 CKMT2P17540 419 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ERVK-21P61565 698 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 GSTM4Q03013 218 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 IMPG1Q17R60 797 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 Q6ZVU0 165 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 DEFB123Q8N688 67 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 METTL25Q8N6Q8 603 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 BDH2Q9BUT1 245 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 KCNH6Q9H252 994 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 FAM83DQ9H4H8 585 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 FAM220BPB1ANY3 271 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 TLL1O43897 1013 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 BMP10O95393 424 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 LDLRP01130 860 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 PGRP06401 933 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 RAP2AP10114 183 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ALDH3B2P48448 385 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 NRIP1P48552 1158 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ERVFC1P60507 584 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 MERTKQ12866 999 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 LIPJQ5W064 366 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 ADI1Q9BV57 179 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRF-212ENST00000477970 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms