RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	ATG9B	Q674R7	924 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ERICH1	Q86X53	443 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FAM219A	Q8IW50	185 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RNF169	Q8NCN4	708 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ACTL9	Q8TC94	416 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MAP6	Q96JE9	813 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NPY6R	Q99463	290 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PSD2	Q9BQI7	771 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	BOC	Q9BWV1	1114 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MMP27	Q9H306	513 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TREX1	Q9NSU2	369 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	STARD10	Q9Y365	291 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		A0A0B4J293	547 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1W2PQM1	296 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DPPA5	A6NC42	116 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CD8B2	A6NJW9	211 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		H0YIG0	161 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	WNT9A	O14904	365 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF4	O60810	478 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF11	O60813	436 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SERPINB7	O75635	380 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SERPINI2	O75830	405 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CALCA	P01258	141 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KRT6A	P02538	564 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RHO	P08100	348 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GIMD1	P0DJR0	217 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	F3	P13726	295 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CBR1	P16152	277 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	UGT1A6	P19224	532 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	HNF1A	P20823	631 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PIK3R1	P27986	724 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SERPINB1	P30740	379 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC1A1	P43005	524 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CAPZB	P47756	277 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ACADVL	P49748	655 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RAP1GDS1	P52306	607 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	EFNA5	P52803	228 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC5A3	P53794	718 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LGALS4	P56470	323 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CXCR4	P61073	352 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CNTN2	Q02246	1040 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GHRHR	Q02643	423 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RUNX2	Q13950	521 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DGCR6	Q14129	220 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CYTH1	Q15438	398 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SLC18A3	Q16572	532 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MAN2A1	Q16706	1144 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		3.15	□□□□□ -1.9

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