RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-215ENST00000447232 NUP43Q8NFH3 380 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 TEKT4Q8WW24 435 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 EXOC2Q96KP1 924 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 ZYG11BQ9C0D3 744 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 SYTL2Q9HCH5 934 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 PIGVQ9NUD9 493 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 VPS18Q9P253 973 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 IMPACTQ9P2X3 320 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 B4GALT6Q9UBX8 382 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 MTMR6Q9Y217 621 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 CR1P17927 2039 aa3.13□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 NPIPA5E9PKD4 350 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 H3BMH7 237 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 ZNF749O43361 778 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 KDELR3O43731 214 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 CD5LO43866 347 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 GOSR1O95249 250 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 WDPCPO95876 746 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 HBQ1P09105 142 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 CYP2A7P20853 494 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 LHCGRP22888 699 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 ACADSBP45954 432 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 ENPEPQ07075 957 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 PAK1Q13153 545 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 STILQ15468 1287 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 AGAP9Q5VTM2 703 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 CNNM4Q6P4Q7 775 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 Q6ZVL8 140 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 NLRP14Q86W24 1093 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 PAQR7Q86WK9 346 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 RPRMLQ8N4K4 120 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 OR11G2Q8NGC1 345 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 GOLGA5Q8TBA6 731 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 FAM57AQ8TBR7 257 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 MED15Q96RN5 788 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 NCAPGQ9BPX3 1015 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 TLR10Q9BXR5 811 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 MAGEH1Q9H213 219 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 FANCEQ9HB96 536 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 SIK3Q9Y2K2 1263 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 VWFP04275 2813 aa3.12□□□□□ -1.91
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PMS1-215ENST00000447232 E5RJQ4 531 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 FAM227AF5H4B4 570 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 PSMD11O00231 422 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
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PMS1-215ENST00000447232 USP1O94782 785 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 F10P00742 488 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 GSTM1P09488 218 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 GPR1P46091 355 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 MAPKAPK2P49137 400 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 PMS1P54277 932 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
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PMS1-215ENST00000447232 TRIM48Q8IWZ4 208 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 PPM1NQ8N819 430 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 LINC01356Q8N9X3 169 aa3.12□□□□□ -1.91
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PMS1-215ENST00000447232 RMI1Q9H9A7 625 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 ST7Q9NRC1 585 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 NDOR1Q9UHB4 597 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 HPCAL4Q9UM19 191 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 NEU3Q9UQ49 428 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 CDYLQ9Y232 598 aa3.12□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 A0A087X1B8 175 aa3.11□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 OR5H15A6NDH6 313 aa3.11□□□□□ -1.91
PMS1-215ENST00000447232 OR5K3A6NET4 321 aa3.11□□□□□ -1.91
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