RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 CAPN10Q9HC96 672 aa10.97□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 IGSF5Q9NSI5 407 aa10.97□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 CRYL1Q9Y2S2 319 aa10.97□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa10.97□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 U3KQV3 271 aa10.97□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 LRRC14BA6NHZ5 514 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 HIDE1A8MVS5 230 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 CCL22O00626 93 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 MGAMO43451 1857 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNK2O95069 426 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 UMPSP11172 480 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PRKACGP22612 351 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 CASP3P42574 277 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 CLK3P49761 638 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PPP5CP53041 499 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 TEAD2Q15562 447 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PAGE3Q5JUK9 113 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PKN3Q6P5Z2 889 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 MICU2Q8IYU8 434 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 GOLM1Q8NBJ4 401 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PIK3C3Q8NEB9 887 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 OR52K2Q8NGK3 314 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 FEM1AQ9BSK4 669 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 CRLS1Q9UJA2 301 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 A8MV72 311 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 TNFRSF10BO14763 440 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 MATN3O15232 486 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 FADS2O95864 444 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 RB1P06400 928 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 RBP1P09455 135 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 SPNP16150 400 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 LBPP18428 481 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 WNT3AP56704 352 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 SCAPQ12770 1279 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 ACAP2Q15057 778 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 MPPE1Q53F39 396 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 ATAT1Q5SQI0 421 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 STEAP3Q658P3 488 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 SPATC1Q76KD6 591 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 LYSMD2Q8IV50 215 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PROX1Q92786 737 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 ADGRE3Q9BY15 652 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM54Q9BYV2 358 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 NTN4Q9HB63 628 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 MAGEE1Q9HCI5 957 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 OSER1Q9NX31 292 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 PKP3Q9Y446 797 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 GPSM3Q9Y4H4 160 aa10.96□□□□□ -0.65
RPRD1B-201ENST00000373433 CCDC154A6NI56 674 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 M0QX08 132 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 GRM6O15303 877 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 GABARAPO95166 117 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 RHOP08100 348 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 FMO3P31513 532 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 MAPKAPK2P49137 400 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 RACK1P63244 317 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 SH3BP2P78314 561 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 PCID2Q5JVF3 399 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 KCTD11Q693B1 232 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 LIMS2Q7Z4I7 341 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 GALNT13Q8IUC8 556 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC22A9Q8IVM8 553 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 NPWQ8N729 165 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 FLCNQ8NFG4 579 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 OVCA2Q8WZ82 227 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 PPM1MQ96MI6 270 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 ARPC5LQ9BPX5 153 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 IL37Q9NZH6 218 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 NCOR1O75376 2440 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 C2orf81A6NN90 581 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 PDZK1P1A8MUH7 402 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 UPK1BO75841 260 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 CST1P01037 141 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 EPCAMP16422 314 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 ATP4BP51164 291 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 MTPNP58546 118 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 RING1Q06587 406 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 PIK3R6Q5UE93 754 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 BEND5Q7L4P6 421 aa10.95□□□□□ -0.66
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms