RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 FJX1Q86VR8 437 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 SERPINA9Q86WD7 417 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC50Q8IVM0 306 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 RHOT2Q8IXI1 618 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 PARP9Q8IXQ6 854 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 CATSPER1Q8NEC5 780 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 OR8K1Q8NGG5 319 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 PPP4R1Q8TF05 950 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 FAR1Q8WVX9 515 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 ULK4Q96C45 1275 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 CNDP1Q96KN2 507 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 DNAJC7Q99615 494 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 HEMGNQ9BXL5 484 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 TXLNGQ9NUQ3 528 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 IRAK4Q9NWZ3 460 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 PRSS21Q9Y6M0 314 aa12.9□□□□□ -0.34
TTPAL-203ENST00000372906 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 A0A0J9YY10 115 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 CFAP99D6REC4 459 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 PRSS44E7EML9 344 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 H7C0C1 242 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 KLHL41O60662 606 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ANXA9O76027 345 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 MMP11P24347 488 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ACRV1P26436 265 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ACADLP28330 430 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 GRNP28799 593 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 MC4RP32245 332 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 SLC1A1P43005 524 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 GCGRP47871 477 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ATP5OP48047 213 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 Q0VFX4 171 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 RPA4Q13156 261 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 TFDP3Q5H9I0 405 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 TLDC1Q6P9B6 456 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 KIRREL2Q6UWL6 708 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 COX15Q7KZN9 410 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 TAS2R42Q7RTR8 314 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 MCEMP1Q8IX19 187 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 PIANPQ8IYJ0 282 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 DTWD1Q8N5C7 304 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 CDC23Q9UJX2 597 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ALG6Q9Y672 507 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 TACC2O95359 2948 aa12.89□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 HACD1B0YJ81 288 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ISM1B1AKI9 464 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 KLHL18O94889 574 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 CRTAMO95727 393 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 CD63P08962 238 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 EDN3P14138 238 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 MCM3P25205 808 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 SHMT2P34897 504 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 TSFMP43897 325 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 PER3P56645 1201 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 NKG7Q16617 165 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 TTLL10Q6ZVT0 673 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 OVCH1Q7RTY7 1134 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 AGAP4Q96P64 663 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 FAM118BQ9BPY3 351 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 NDC1Q9BTX1 674 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 EURLQ9NYK6 297 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 PLCL2Q9UPR0 1127 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ASF1AQ9Y294 204 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 AKAP9Q99996 3911 aa12.88□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 PSTPIP1O43586 416 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 STSP08842 583 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 TPH1P17752 444 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 MAGP20916 626 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 GRIA3P42263 894 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 KCNK10P57789 538 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 DBN1Q16643 649 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 GPR33Q49SQ1 333 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF449Q6P9G9 518 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 LINC00696Q6ZRV3 163 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 RCOR2Q8IZ40 523 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 SPC24Q8NBT2 197 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC110Q8TBZ0 833 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 HEXDCQ8WVB3 486 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 KRT35Q92764 455 aa12.87□□□□□ -0.35
TTPAL-203ENST00000372906 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms