RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACNG4Q9UBN1 327 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF150Q9ULK6 438 aa2.5□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 FLT1P17948 1338 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR81Q562E7 1941 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0G2JLW4 131 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PN81 502 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEMP2A6NFY4 417 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNM1LO00429 736 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLOD2O00469 737 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTGESO14684 152 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIGNO95427 931 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACSL3O95573 720 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSPA4LO95757 839 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGHV2-70P01814 119 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 QDPRP09417 244 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR52Z1P0C646 297 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP11B2P19099 503 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD22P20273 847 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CA4P22748 312 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANOS1P23352 680 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTAFRP25105 342 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHRNA7P36544 502 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 LHX1P48742 406 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBPJQ06330 500 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 MZT1Q08AG7 82 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CA9Q16790 459 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ODF4Q2M2E3 257 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 HYAL4Q2M3T9 481 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYT14P1Q58G82 188 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCTE1Q5JU00 501 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCAF10Q5QP82 559 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUP54Q7Z3B4 507 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TLK2Q86UE8 772 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDT13Q86X67 352 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF611Q8N823 705 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF383Q8NA42 475 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 IQUBQ8NA54 791 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR10V1Q8NGI7 309 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRHL3Q8TE85 626 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCAMRQ8WWV6 532 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSD17B8Q92506 261 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM143Q96AN5 459 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIPA1Q96FS4 1042 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 RMDN2Q96LZ7 410 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPAG5Q96R06 1193 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPNE1Q99829 537 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 EDEM3Q9BZQ6 932 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM129AQ9BZQ8 928 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAT2Q9GZY6 243 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIS12Q9H081 205 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SDF2L1Q9HCN8 221 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADPRHL2Q9NX46 363 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRWD1Q9UFC0 647 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 DAPK2Q9UIK4 370 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCF19Q9Y242 345 aa2.49□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD61A6NGH8 418 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC188H7C350 402 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP6V0E1O15342 81 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBCAO75347 108 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PENKP01210 267 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMIM18P0DKX4 95 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 JAK1P23458 1154 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTGER4P35408 488 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 NPY4RP50391 375 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIMK1P53667 647 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF415Q09FC8 603 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR17Q13304 367 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGP2Q16851 508 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHLDA2Q53GA4 152 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPECC1Q5M775 1068 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf50Q5SZB4 431 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGEF16Q5VV41 709 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 MFSD6Q6ZSS7 791 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADCK2Q7Z695 626 aa2.48□□□□□ -2.01
RNU6-78P-201ENST00000362897 VSIG1Q86XK7 387 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms