RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SAMD11Q96NU1 681 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FBRSQ9HAH7 460 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LIPT1Q9Y234 373 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TLR6Q9Y2C9 796 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PP18 115 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PPW3 197 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MEGF11A6BM72 1044 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TOR1BO14657 336 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ATG13O75143 517 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF21O75509 655 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CTNNB1P35222 781 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CD97P48960 835 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM8P78325 824 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PGS1Q32NB8 556 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TIGD3Q6B0B8 471 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CHST9Q7L1S5 443 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM139Q8IV31 216 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RNF217Q8TC41 542 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FATE1Q969F0 183 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 EFCAB11Q9BUY7 163 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM27Q9HBJ8 222 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 VWA7Q9Y334 891 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TTLL13PA6NNM8 815 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM10O14672 748 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NDST3O95803 873 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IL32P24001 234 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MIPP30301 263 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TAS2R41P59536 307 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IL10RBQ08334 325 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PTPN20Q4JDL3 420 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ATCAYQ86WG3 371 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SELENOMQ8WWX9 145 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLAMF9Q96A28 289 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB118Q96PH6 123 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR52E6Q96RD3 313 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CEP41Q9BYV8 373 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CDHR5Q9HBB8 845 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IFT46Q9NQC8 304 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC167Q9P0B6 97 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PHIPQ8WWQ0 1821 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CCRL2O00421 344 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 P2RX6O15547 441 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HSPA12AO43301 675 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 AP1G1O43747 822 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PPM1BO75688 479 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RB1P06400 928 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ARP10275 920 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RHOQP17081 205 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UGT1A1P22309 533 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RAB5CP51148 216 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DPYSL2Q16555 572 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CBWD6Q4V339 395 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TEX44Q53QW1 395 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR4L1Q8NH43 312 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PPTC7Q8NI37 304 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP16Q9BY84 665 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SRRDQ9UH36 339 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL21Q9UJP4 597 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF222Q9UK12 451 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CMAHPQ9Y471 501 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 WDR81Q562E7 1941 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms