RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345807.6

CLTB-202, Transcript of clathrin light chain B, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLTB, Length 1,161 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTB-202ENST00000345807 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 OTX2P32243 289 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 CCR7P32248 378 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 PRAMEP78395 509 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 SNX1Q13596 522 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 SEMA3AQ14563 771 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 KIR2DS3Q14952 304 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 SLC5A12Q1EHB4 618 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 MLIPQ5VWP3 458 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 SLC22A15Q8IZD6 547 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 GLIS1Q8NBF1 620 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 NUDT9Q9BW91 350 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 NAV2Q8IVL1 2488 aa21.89■■□□□ 1.1
CLTB-202ENST00000345807 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 DPM1O60762 260 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 APRTP07741 180 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 CTSBP07858 339 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 ATXN8OSP0DMR3 200 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 CDC25BP30305 580 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 HSPA14Q0VDF9 509 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 VRK3Q8IV63 474 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 DNAJC22Q8N4W6 341 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 CCDC89Q8N998 374 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 GALNT11Q8NCW6 608 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 PROKR1Q8TCW9 393 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 SGSM3Q96HU1 749 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 GBP5Q96PP8 586 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 CARD6Q9BX69 1037 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 IRAK4Q9NWZ3 460 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 PAK5Q9P286 719 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 PCSK5Q92824 1860 aa21.89■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 SEC16AO15027 2179 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 PKLRP30613 574 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 UQCRFS1P47985 274 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 RAB28P51157 221 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 DCDP81605 110 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 KYNUQ16719 465 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 TLDC1Q6P9B6 456 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 HPS6Q86YV9 775 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 ASZ1Q8WWH4 475 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 PEX13Q92968 403 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 GPR83Q9NYM4 423 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 NDOR1Q9UHB4 597 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 ANAPC5Q9UJX4 755 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 GUCA1BQ9UMX6 200 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 PLCL2Q9UPR0 1127 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 CDYLQ9Y232 598 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa21.88■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 IQCF5A8MTL0 148 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 GPC4O75487 556 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 RPN2P04844 631 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 GNLYP22749 145 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 FOLR3P41439 243 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 SSPNQ14714 243 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 MRGPREQ86SM8 312 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 FAM20CQ8IXL6 584 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 LINC01555Q8NAE3 123 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 CFAP61Q8NHU2 1237 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 IP6K3Q96PC2 410 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 MFRPQ9BY79 579 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 CATSPERZQ9NTU4 200 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 FER1L5A0AVI2 2057 aa21.87■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 KRT86O43790 486 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 APOA4P06727 396 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 CD63P08962 238 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 GP1BBP13224 206 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 MAGP20916 626 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 RAPSNQ13702 412 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 SLC9A5Q14940 896 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 UNC5DQ6UXZ4 953 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 KRT222Q8N1A0 295 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 NDC1Q9BTX1 674 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 MENTQ9BUN1 341 aa21.86■■□□□ 1.09
CLTB-202ENST00000345807 CHRAC1Q9NRG0 131 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms