RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 LIPMQ5VYY2 423 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 PIGWQ7Z7B1 504 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 NATD1Q8N6N6 113 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 RHEBL1Q8TAI7 183 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1191Q96A73 305 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CMTM3Q96MX0 182 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 LMAN1LQ9HAT1 526 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 BRD7Q9NPI1 651 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 WNT16Q9UBV4 365 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CDK2AP1O14519 115 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 PCCBP05166 539 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 GABRG2P18507 467 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 KCNC1P48547 511 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SLC1A6P48664 564 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 STARD6P59095 220 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 DNAJB13P59910 316 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 Q3ZCU0 254 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 PNCKQ6P2M8 343 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 IYDQ6PHW0 289 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 KBTBD6Q86V97 674 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 GRAMD1AQ96CP6 724 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 C7orf26Q96N11 449 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CIB1Q99828 191 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CRLF2Q9HC73 371 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 RNF112Q9ULX5 631 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.93□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 A8MT66 165 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 TMEM114B3SHH9 223 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CDC7O00311 574 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 QSOX1O00391 747 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 BTN3A1O00481 513 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ITM2AO43736 263 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 KERAO60938 352 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SEMA3DO95025 777 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 FTH1P02794 183 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CBSLP0DN79 551 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 AOAHP28039 575 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CCR7P32248 378 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CBSP35520 551 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 RGS4P49798 205 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 OCRLQ01968 901 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 BLMHQ13867 455 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 FGL2Q14314 439 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 TMEM259Q4ZIN3 620 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ACSBG2Q5FVE4 666 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 TMEM154Q6P9G4 183 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 FAM124AQ86V42 546 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 OR8H1Q8NGG4 311 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CCDC126Q96EE4 140 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SHDQ96IW2 340 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ATOH8Q96SQ7 321 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 C20orf27Q9GZN8 174 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 LTB4R2Q9NPC1 389 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CD93Q9NPY3 652 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 THAP1Q9NVV9 213 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQU0 124 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 KANSL1LA0AUZ9 987 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 PRR23AA6NEV1 266 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 OR2AG2A6NM03 316 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ALOX5P09917 674 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 CBX5P45973 191 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 PRLHRP49683 370 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 THOP1P52888 689 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 VBP1P61758 197 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 NFKB2Q00653 900 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 OVGP1Q12889 678 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 SGCGQ13326 291 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 FZD5Q13467 585 aa5.92□□□□□ -1.46
CCR6-201ENST00000341935 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms