RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
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SOCS1-201ENST00000332029 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 SEC16AO15027 2179 aa20.39■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 UNC79Q9P2D8 2635 aa20.39■□□□□ 0.85
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SOCS1-201ENST00000332029 GPR135Q8IZ08 494 aa20.37■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.37■□□□□ 0.85
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SOCS1-201ENST00000332029 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 MRGPREQ86SM8 312 aa20.36■□□□□ 0.85
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SOCS1-201ENST00000332029 PEX13Q92968 403 aa20.36■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.36■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.36■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 TPBGLP0DKB5 382 aa20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 UGT2B7P16662 529 aa20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 KYNUQ16719 465 aa20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 TCTN2Q96GX1 697 aa20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 OR2A14Q96R47 310 aa20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 FAM60AQ9NP50 221 aa20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 SPHK1Q9NYA1 384 aa20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 C5AR2Q9P296 337 aa20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa20.35■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 KDM1AO60341 852 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 OR2B3O76000 313 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 CBSLP0DN79 551 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 CCR7P32248 378 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 CBSP35520 551 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 SEMA3AQ14563 771 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 ESPL1Q14674 2120 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 SSPNQ14714 243 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 ZIC1Q15915 447 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 PCID2Q5JVF3 399 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 C1orf189Q5VU69 101 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 MLIPQ5VWP3 458 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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SOCS1-201ENST00000332029 CARD6Q9BX69 1037 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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SOCS1-201ENST00000332029 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.34■□□□□ 0.85
SOCS1-201ENST00000332029 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.34■□□□□ 0.85
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