RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 DOK6Q6PKX4 331 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TSPAN33Q86UF1 283 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ERVK-6Q9BXR3 956 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ERVK-18Q9QC07 812 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 NME6O75414 186 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TROAPQ12815 778 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FSTL1Q12841 308 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PDK4Q16654 411 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF311Q5JNZ3 666 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 VCPIP1Q96JH7 1222 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM86C1Q9NVL1 165 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ASF1BQ9NVP2 202 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 GPATCH2Q9NW75 528 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HCRTR2O43614 444 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 GRIA2P42262 883 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CAMLGP49069 296 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 IQCF1Q8N6M8 205 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 POGLUT1Q8NBL1 392 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 WACQ9BTA9 647 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM27Q9HBJ8 222 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HCN2Q9UL51 889 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 KLHL33A6NCF5 533 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FCER2P06734 321 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CD9P21926 228 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 C12orf40Q86WS4 652 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FEM1AQ9BSK4 669 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CCR1P32246 355 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CRISP1P54107 249 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ACOT1Q86TX2 421 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SPPL2CQ8IUH8 684 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 BEST3Q8N1M1 668 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CENPSQ8N2Z9 138 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CBR4Q8N4T8 237 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FITM2Q8N6M3 262 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TAS2R10Q9NYW0 307 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 H7C4K7 107 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 C2CD2LO14523 706 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 AGTR1P30556 359 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ARHGAP8P85298 464 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM44Q2T9K0 475 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 IQCCQ4KMZ1 466 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 COPZ2Q9P299 210 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM86B1E9PN63 330 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CCR10P46092 362 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 OR4Q3Q8NH05 313 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SUN3Q8TAQ9 357 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MYNNQ9NPC7 610 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 J3QRK9 145 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RFPL1O75677 317 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 MAP4K2Q12851 820 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 OR2T12Q8NG77 320 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FBXL8Q96CD0 374 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HTATIP2Q9BUP3 242 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A096LPI6 279 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CBX4O00257 560 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 FFAR3O14843 346 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 GPR42O15529 346 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CIDEAO60543 219 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 AQP1P29972 269 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 RIPOR3Q96MK2 946 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 OR51V1Q9H2C8 321 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ALG2Q9H553 416 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 NYAP2Q9P242 653 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC7A8Q9UHI5 535 aa10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF136P52737 540 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 PRR5P85299 388 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 HAS2Q92819 552 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CREBZFQ9NS37 354 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZBTB7AO95365 584 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 TGDSO95455 350 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 XKR6Q5GH73 641 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ADGRA1Q86SQ6 560 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ACTL9Q8TC94 416 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF347Q96SE7 839 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 CCDC32Q9BV29 185 aa10.97□□□□□ -0.65
HDGFL3-201ENST00000299633 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms