RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 DCSTAMPQ9H295 470 aa20.77■□□□□ 0.92
CSNK1G2-201ENST00000255641 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.77■□□□□ 0.92
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRT87PA6NCN2 255 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEC22BO75396 215 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 VPS26AO75436 327 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 FGF1P05230 155 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 PGRP06401 933 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 CA5AP35218 305 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLK1P49759 484 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 FCGRTP55899 365 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP4F2P78329 520 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 GTF2H2Q13888 395 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIK3C3Q8NEB9 887 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.77■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 PER2O15055 1255 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 VIPP01282 170 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALOX5P09917 674 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRK5P34947 590 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARPP19P56211 112 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRIK2Q13002 908 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERINC3Q13530 473 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERPINB11Q96P15 392 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF382Q96SR6 550 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 STX16O14662 325 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 MGEA5O60502 916 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERPINF2P08697 491 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALOX12P18054 663 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUDT6P53370 316 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRISP3P54108 245 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 COPZ1P61923 177 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 TEX26Q8N6G2 289 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHOXF1Q8NHV9 184 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 CTRCQ99895 268 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 SIRT5Q9NXA8 310 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 USE1Q9NZ43 259 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 GABRQQ9UN88 632 aa20.76■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARNTLO00327 626 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 CREMQ03060 361 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBE2UQ5VVX9 321 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFNL1Q8IU54 200 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 SVOPLQ8N434 492 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRPV1Q8NER1 839 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSSK3Q96PN8 268 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 OPTCQ9UBM4 332 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 B4GALT3O60512 393 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRAMEF12O95522 483 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 HLA-DPA1P20036 260 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 AKT1P31749 480 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 TGFBR2P37173 567 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 SERPINB10P48595 397 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 CPZQ66K79 652 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR8J3Q8NGG0 315 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 BOLA1Q9Y3E2 137 aa20.75■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 NDST3O95803 873 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 GADD45AP24522 165 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRAF3Q13114 568 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 29.3
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF175Q8N4F7 328 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 TADA1Q96BN2 335 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC12A8A0AV02 714 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 NBNO60934 754 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC159P0C7I6 412 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACVR2AP27037 513 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCNQ1P51787 676 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZXDBP98169 803 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAP1Q01518 475 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 C17orf99Q6UX52 265 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC39A13Q96H72 371 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 EGLN2Q96KS0 407 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 EGFL8Q99944 293 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 RMND5AQ9H871 391 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPRC5BQ9NZH0 403 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CSNK1G2-201ENST00000255641 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms