RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 IL23RQ5VWK5 629 aa10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM150AQ86TG1 271 aa10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TMC8Q8IU68 726 aa10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJB14Q8TBM8 379 aa10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PCTPQ9UKL6 214 aa10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CCL26Q9Y258 94 aa10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 WASF2Q9Y6W5 498 aa10.4□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 A0A0U1RQS6 177 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 C16orf96A6NNT2 1141 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 H3BM21 787 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 RPS17P08708 135 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SBK3P0C264 359 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SP140Q13342 867 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TUBB3Q13509 450 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MAPKAPK3Q16644 382 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TCEAL5Q5H9L2 206 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CES4AQ5XG92 561 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 Q6ZVL8 140 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 NEK10Q6ZWH5 1172 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CHST14Q8NCH0 376 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FBXO27Q8NI29 283 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TSPEARQ8WU66 669 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 C19orf43Q9BQ61 176 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 BOCQ9BWV1 1114 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CD244Q9BZW8 370 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 EBF3Q9H4W6 596 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SLC32A1Q9H598 525 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PREBQ9HCU5 417 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PCDH12Q9NPG4 1184 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 KCNE2Q9Y6J6 123 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CPED1A4D0V7 1026 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LINC01553A4QN01 128 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PCNAP12004 261 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FASP25445 335 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SOX11P35716 441 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ACSM2AQ08AH3 577 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PGS1Q32NB8 556 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PAGE2BQ5JRK9 111 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ACSM2BQ68CK6 577 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM207Q6UWW9 146 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TRAM1L1Q8N609 369 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 OR4F6Q8NGB9 312 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FAM162AQ96A26 154 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CDK15Q96Q40 435 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MUC13Q9H3R2 512 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MAPRE3Q9UPY8 281 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FAM234BA2RU67 622 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TTC34A8MYJ7 566 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FZD6O60353 706 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GRIK2Q13002 908 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 XKR6Q5GH73 641 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SYVN1Q86TM6 617 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 AADATQ8N5Z0 425 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SMARCD2Q92925 531 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 BIRC8Q96P09 236 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 SLC29A3Q9BZD2 475 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PDP2Q9P2J9 529 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 KLHL42Q9P2K6 505 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 COL4A2P08572 1712 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MYO18BQ8IUG5 2567 aa10.39□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF195O14628 629 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 EBLN1P0CF75 366 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CEBPBP17676 345 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GRIA3P42263 894 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM220Q6QAJ8 160 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 FAM217AQ8IXS0 508 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 GPR26Q8NDV2 337 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ASB9Q96DX5 294 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ZFYVE19Q96K21 471 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 OR51B4Q9Y5P0 310 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TRANK1O15050 2925 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 MGAT4DA6NG13 374 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 TPST1O60507 370 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ARRB2P32121 409 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 ARHGDIAP52565 204 aa10.38□□□□□ -0.75
PRRX1-201ENST00000239461 CHRNB3Q05901 458 aa10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms