RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhbdl2A2AGA4 302 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r94E9PZK8 818 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm2888K7N746 267 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MlxO08609 298 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sod3O09164 251 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Azin1O35484 448 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DckP43346 260 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkn2bP55271 130 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dsc1P55849 886 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col6a2Q02788 1034 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem173Q3TBT3 378 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spire1Q52KF3 598 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actr3bQ641P0 418 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam83eQ80XS7 481 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FicdQ8BIX9 458 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nrn1lQ8C4W3 162 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sirt5Q8K2C6 310 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Macrod1Q922B1 323 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrkxQ922R0 355 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mgat4dQ9D4R2 373 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trem1Q9JKE2 230 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc7a9Q9QXA6 487 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nufip1Q9QXX8 484 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad9aQ9Z0F6 389 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13283A0A087WPG5 182 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcf2A2AEU1 1111 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mgat4eA6H684 439 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7275E9Q1B3 247 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmb10O35955 273 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtsdP18242 410 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cbx3P23198 183 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RxraP28700 467 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acvr1P37172 509 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ufm1P61961 85 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf13P70377 245 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UcmaQ14BU0 138 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpne9Q1RLL3 553 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5800Q497L3 186 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam20cQ5MJS3 579 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam126aQ6P9N1 521 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35c2Q8VCX2 364 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr866Q8VFI7 312 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1208Q8VG47 308 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NpntQ91V88 561 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdkal1Q91WE6 578 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 WwoxQ91WL8 414 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdha8Q91Y12 946 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc40Q9CRC8 602 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc81Q9D5W4 654 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Carm1Q9WVG6 608 aa12.4□□□□□ -0.42
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssxb6A2BI74 170 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erich1E9PY43 332 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3526E9PZM0 191 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sypl1O09117 261 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MaffO54791 156 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01636 108 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Drd4P51436 387 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LcorlQ3U285 600 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Letm2Q7TNU7 480 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr141Q7TQP0 305 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sgo2Q7TSY8 1164 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt75Q8BGZ7 551 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r214Q8R279 367 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hdac11Q91WA3 347 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D1K7 174 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhx34Q9DBV3 1145 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il22Q9JJY9 179 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Osbpl10S4R1M9 766 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spaca6E9Q8Q8 339 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r46L7N282 809 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdcd5P56812 126 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc30a3P97441 388 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ChatQ03059 641 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss55Q14BX2 321 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rsrp1Q3UC65 298 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts16Q69Z28 1222 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SvoplQ6PDF3 494 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps9Q6ZWN5 194 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Timm29Q8BGX2 266 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem72Q8C3K5 275 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtnr1bQ8CIQ6 364 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ManbaQ8K2I4 879 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cant1Q8VCF1 403 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdhr5Q8VHF2 831 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf24Q91VN1 368 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankra2Q99PE2 312 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cmc1Q9CPZ8 106 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ist1Q9CX00 362 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmbim6Q9D2C7 237 aa12.39□□□□□ -0.43
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bpifa3Q9D9J8 232 aa12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.1 ms