RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 LRIG1Q96JA1 1093 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 STRA6Q9BX79 667 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 EBPLQ9BY08 206 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 RNF186Q9NXI6 227 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 GNSP15586 552 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PROZP22891 400 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ACTR1BP42025 376 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ACTR1AP61163 376 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 TEAD2Q15562 447 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CILP2Q8IUL8 1156 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 GIPC3Q8TF64 312 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 SHDQ96IW2 340 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PDLIM7Q9NR12 457 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 DNAJB4Q9UDY4 337 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 SCAPQ12770 1279 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 MED22Q15528 200 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 MAPK11Q15759 364 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 EIPR1Q53HC9 387 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 FRG2Q64ET8 278 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 IKBIPQ70UQ0 350 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF280BQ86YH2 543 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PIGXQ8TBF5 258 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 IRF7Q92985 503 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 KIAA1191Q96A73 305 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ESAMQ96AP7 390 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 FRG2BQ96QU4 278 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CLDND1Q9NY35 253 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 POMPQ9Y244 141 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 SESN1Q9Y6P5 492 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 RGS10O43665 173 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CHRNA1P02708 482 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 RAP2AP10114 183 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CYP4B1P13584 511 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 FOXM1Q08050 763 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PITRM1Q5JRX3 1037 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ZZZ3Q8IYH5 903 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNJ9Q92806 393 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 PLGRKTQ9HBL7 147 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGEF3Q9NR81 526 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 TAS2R1Q9NYW7 299 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 STX16O14662 325 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 DLX3O60479 287 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CLDN7O95471 211 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ALAS2P22557 587 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 NRLP54845 237 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ADARP55265 1226 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 HBEGFQ99075 208 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ELOVL2Q9NXB9 296 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 NBNO60934 754 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CNTN5O94779 1100 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 GJA1P17302 382 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 HSPB3Q12988 150 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNC3Q14003 757 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 C1orf220Q5T0J3 134 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM129CQ86XR2 697 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 IZUMO1Q8IYV9 350 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 GLIS1Q8NBF1 620 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 POF1BQ8WVV4 589 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 RGMAQ96B86 450 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CMTM7Q96FZ5 175 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF358Q9NW07 568 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CIDEBQ9UHD4 219 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CCNB2O95067 398 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 MATN4O95460 622 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 AGR2O95994 175 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 SAGP10523 405 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 DBTP11182 482 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 MPIP34949 423 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CCR10P46092 362 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 LRRC32Q14392 662 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 SEMA3AQ14563 771 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 SNAPC1Q16533 368 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 C2orf27AQ580R0 203 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 LRRC73Q5JTD7 316 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 GPR107Q5VW38 600 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM171BQ6P995 826 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 DNAJB9Q9UBS3 223 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 COQ6Q9Y2Z9 468 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 WNT6Q9Y6F9 365 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 A0A1W2PRB8 838 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRVP-205ENST00000641549 NEMP2A6NFY4 417 aa13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms