RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 UBXN7O94888 489 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ITGAXP20702 1163 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CD247P20963 164 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CAPGP40121 348 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KCNQ1P51787 676 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CHRNA6Q15825 494 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MSS51Q4VC12 460 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RNF44Q7L0R7 432 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NUDT13Q86X67 352 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SCML4Q8N228 414 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PIGXQ8TBF5 258 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GIPC3Q8TF64 312 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TRIB2Q92519 343 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NR4A3Q92570 626 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC38A4Q969I6 547 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RGMAQ96B86 450 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GKN1Q9NS71 199 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN32Q9NX65 697 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EHD3Q9NZN3 535 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 HAS3O00219 553 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PCDH7O60245 1069 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TNFP01375 233 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MPC1LP0DKB6 136 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GRIA1P42261 906 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CTSKP43235 329 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DGCR6Q14129 220 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 STEAP4Q687X5 459 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FAM47BQ8NA70 645 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TRPV1Q8NER1 839 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RFKQ969G6 155 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RHBDL2Q9NX52 303 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 POMPQ9Y244 141 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 M0QZQ0 153 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ITM2AO43736 263 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PGLSO95336 258 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SEC24AO95486 1093 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CHRNGP07510 517 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NT5EP21589 574 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF563Q8TA94 476 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KCNJ9Q92806 393 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MYOCQ99972 504 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NIPSNAP2O75323 286 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ALPIP09923 528 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SUOXP51687 545 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ATP1A4Q13733 1029 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC9A5Q14940 896 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PCLAFQ15004 111 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C17orf99Q6UX52 265 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RTP4Q96DX8 246 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EBPLQ9BY08 206 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DUXAA6NLW8 204 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KMOO15229 486 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 COCHO43405 550 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FAM189A1O60320 539 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OAZ2O95190 189 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ALOX5P09917 674 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CDH3P22223 829 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IL12AP29459 219 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 WASP42768 502 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC32Q14392 662 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TEAD2Q15562 447 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FCGR1BQ92637 280 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LMLNQ96KR4 655 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.34□□□□□ -1.39
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