RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFL3Q6UXB1 125 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC5AQ6ZN44 842 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 HOOK3Q86VS8 718 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ARNT2Q9HBZ2 717 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 P4HTMQ9NXG6 502 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SPHK1Q9NYA1 384 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CDYLQ9Y232 598 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX12O00623 359 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ALPPP05187 535 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CRB2Q5IJ48 1285 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF449Q6P9G9 518 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R42Q7RTR8 314 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PIANPQ8IYJ0 282 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2Y1Q8NGV0 311 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PROKR1Q8TCW9 393 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA13Q96N96 652 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 FERMT1Q9BQL6 677 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 NDOR1Q9UHB4 597 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A6Q9Y289 635 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 H7C0S8 307 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PJA2O43164 708 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TPBGLP0DKB5 382 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 RBP3P10745 1247 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SHMT2P34897 504 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 DCDP81605 110 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 DBN1Q16643 649 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CNGA4Q8IV77 575 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 NTNG1Q9Y2I2 539 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS21Q9Y6M0 314 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO9AB2RTY4 2548 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKUB1A6NFN9 424 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 UMODP07911 640 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 COPS2P61201 443 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ASF1AQ9Y294 204 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0J9YY10 115 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 STK10O94804 968 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHEP01854 428 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTM1P09488 218 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TPH1P17752 444 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CTNNA2P26232 953 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 ACADLP28330 430 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTM4Q03013 218 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 BRD3Q15059 726 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PTERQ96BW5 349 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf34Q96MH7 638 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PLAGL1Q9UM63 463 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 FER1L5A0AVI2 2057 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 AP2A2O94973 939 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNG1Q06432 222 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD11Q693B1 232 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 NAPRTQ6XQN6 538 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZS92 163 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CUZD1Q86UP6 607 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC22Q8N4W6 341 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A11Q9NSA0 550 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TXLNGQ9NUQ3 528 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 SRPK3Q9UPE1 567 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 CSAG2Q9Y5P2 127 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-211ENST00000590874 IPO13O94829 963 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 CD63P08962 238 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-211ENST00000590874 GLRBP48167 497 aa24.7■■□□□ 1.54
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