RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589753.1

ATG4D-211, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 931 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-211ENST00000589753 TLCD1Q96CP7 247 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 APOPT1Q96IL0 206 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 SCYL1Q96KG9 808 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 ALG9Q9H6U8 611 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 PARVBQ9HBI1 364 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 MKS1Q9NXB0 559 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 PDE10AQ9Y233 779 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4D-211ENST00000589753 KDM1AO60341 852 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 GFRA3O60609 400 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 SPAG7O75391 227 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 RBP1P09455 135 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 CREB1P16220 341 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 HIST1H2ADP20671 130 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 PHKG1Q16816 387 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 STPG1Q5TH74 334 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 NAXDQ8IW45 347 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 RNF112Q9ULX5 631 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 PADI4Q9UM07 663 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 OARD1Q9Y530 152 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 KNL1Q8NG31 2342 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 MYO1CO00159 1063 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 PPM1DO15297 605 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 SH3BP5O60239 455 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 KERAO60938 352 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 MYF5P13349 255 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 GLB1P16278 677 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 AP1S2P56377 157 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 GPR18Q14330 331 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 GRB7Q14451 532 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 PROX2Q3B8N5 592 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 TTMPQ5BVD1 217 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 C16orf46Q6P387 395 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 GPSM1Q86YR5 675 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 UCK1Q9HA47 277 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 RDH14Q9HBH5 336 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 LRIT1Q9P2V4 623 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 XPR1Q9UBH6 696 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 RNF215Q9Y6U7 377 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 U3KQA8 63 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 SYCE1LA8MT33 242 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 TYROBPO43914 113 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 TPBGLP0DKB5 382 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 CKMT1AP12532 417 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 KCNC1P48547 511 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 LIMK1P53667 647 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 DAB2P98082 770 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 CDKL1Q00532 357 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 PLCL1Q15111 1095 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 TGFBIQ15582 683 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 CCDC153Q494R4 210 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4D-211ENST00000589753 LCN9Q8WX39 176 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms