RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 CDH19Q9H159 772 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 Q9H521 79 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 COG4Q9H9E3 785 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 POPDC3Q9HBV1 291 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PCDH12Q9NPG4 1184 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RGS18Q9NS28 235 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SEMA4GQ9NTN9 838 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 KCTD5Q9NXV2 234 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NDUFA13Q9P0J0 144 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM216Q9P0N5 145 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TSC2P49815 1807 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NUP205Q92621 2012 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 G3V2L1 256 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FAM72CH0Y354 149 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 DFFAO00273 331 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GPR39O43194 453 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 UGT1A9O60656 530 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 VPS4BO75351 444 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ENTPD5O75356 428 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TADA2AO75478 443 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GPC4O75487 556 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PIAS1O75925 651 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PRKD3O94806 890 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PRSS23O95084 383 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 VAPBO95292 243 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GSRP00390 522 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 IGLV2-14P01704 120 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ALDH2P05091 517 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RPSAP08865 295 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 KITP10721 976 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 COX4I1P13073 169 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CYBAP13498 195 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 OSMP13725 252 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ANPEPP15144 967 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HLA-DPA1P20036 260 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 BDNFP23560 247 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ADRA1AP35348 466 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PPP3CCP48454 512 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 HSPA13P48723 471 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TUFMP49411 452 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NUMBP49757 651 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRM-215ENST00000583289 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TBX4P57082 545 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CREMQ03060 361 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 KDSRQ06136 332 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 IL10RBQ08334 325 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CDC16Q13042 620 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RCN2Q14257 317 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ACAP2Q15057 778 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RCN1Q15293 331 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RABGAP1LQ5R372 815 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FAM72AQ5TYM5 149 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MANEALQ5VSG8 457 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 MRNIPQ6NTE8 343 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PGM2L1Q6PCE3 622 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRM-215ENST00000583289 FAM72BQ86X60 149 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RASAL3Q86YV0 1011 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRM-215ENST00000583289 TEX26Q8N6G2 289 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 GPATCH11Q8N954 259 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 SPPL2BQ8TCT7 592 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 TOP1MTQ969P6 601 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-215ENST00000583289 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.5□□□□□ -1.69
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