RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	CALML4	Q96GE6	196 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	OR2A14	Q96R47	310 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	EPYC	Q99645	322 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	FKRP	Q9H9S5	495 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	TONSL	Q96HA7	1378 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	CACNA1B	Q00975	2339 aa		3.21	□□□□□ -1.89
COX11-208	ENST00000576084	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	PPIP5K2	O43314	1243 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	GJB3	O75712	270 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	TPPP	O94811	219 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	IGHV4-39	P01824	125 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	ICAM1	P05362	532 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	GM2A	P17900	193 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	ACADL	P28330	430 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	MMP14	P50281	582 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	FKBP1B	P68106	108 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	COG7	P83436	770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SP3	Q02447	781 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	OR52I2	Q8NH67	350 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	MOAP1	Q96BY2	351 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	ZNF524	Q96C55	264 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	NEURL2	Q9BR09	285 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	PIGM	Q9H3S5	423 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	STK39	Q9UEW8	545 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084		B4DLN1	442 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	HIST1H2AB	P04908	130 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	CCL5	P13501	91 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SELL	P14151	372 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	HIST1H2AD	P20671	130 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	CDKN1A	P38936	164 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SLC15A1	P46059	708 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	GPR143	P51810	404 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	CDC16	Q13042	620 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	GAGE5	Q13069	117 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	GAGE6	Q13070	117 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	MYLK3	Q32MK0	819 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	GPR180	Q86V85	440 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	LINGO1	Q96FE5	620 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	ZNF583	Q96ND8	569 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	GFI1	Q99684	422 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SIL1	Q9H173	461 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	THEG	Q9P2T0	379 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	NENF	Q9UMX5	172 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	CMAHP	Q9Y471	501 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084		A0A1W2PP64	1363 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	RTL1	A6NKG5	1358 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	ALPK3	Q96L96	1907 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	CDH23	Q9H251	3354 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		3.19	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084		A0A1W2PQ09	198 aa		3.19	□□□□□ -1.9
COX11-208	ENST00000576084		A0A1W2PR77	199 aa		3.19	□□□□□ -1.9

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