RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	NLN	Q9BYT8	704 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ASB1	Q9Y576	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076		A0A0G2JNG1	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076		A0A0U1RQS6	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	OR5K4	A6NMS3	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CETN3	O15182	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	INSIG1	O15503	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GRAP2	O75791	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CALCA	P01258	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	IGHE	P01854	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MME	P08473	750 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CA5A	P35218	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CSNK1D	P48730	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	POLD2	P49005	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CDK3	Q00526	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GCNT1	Q02742	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	TLE4	Q04727	773 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LRMP	Q12912	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RALGDS	Q12967	914 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PDCL	Q13371	301 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	RIN1	Q13671	783 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CYTH1	Q15438	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	FOXC2	Q99958	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCFD1-223	ENST00000557076	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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