RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549278.1

AC024909.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC024909.1, Length 599 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC024909.1-201ENST00000549278 HSD17B2P37059 387 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PIK3CBP42338 1070 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CASP2P42575 452 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CCR10P46092 362 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 KCNQ1P51787 676 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 DIO3P55073 304 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 DCDC1P59894 354 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ERVPABLB-1P60509 514 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 UFM1P61960 85 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RPS14P62263 151 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TUBA1BP68363 451 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PHEXP78562 749 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CYP4F3Q08477 520 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RBBP4Q09028 425 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RALGDSQ12967 914 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 LAPTM5Q13571 262 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 KEAP1Q14145 624 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NEK5Q6P3R8 708 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SBSNQ6UWP8 590 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 UNC5DQ6UXZ4 953 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TUBA1AQ71U36 451 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PIM3Q86V86 326 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NLRP8Q86W28 1048 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 IFNEQ86WN2 208 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NRSN1Q8IZ57 195 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NXPE1Q8N323 547 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FIBCD1Q8N539 461 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 GALNT6Q8NCL4 622 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 DBF4BQ8NFT6 615 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PJA1Q8NG27 643 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 OR4F6Q8NGB9 312 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 OR2AP1Q8NGE2 309 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PIH1D2Q8WWB5 315 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 GTF2H4Q92759 462 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 EXT2Q93063 718 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM162AQ96A26 154 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RHBDF1Q96CC6 855 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ISOC1Q96CN7 298 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ITPKCQ96DU7 683 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 MTERF3Q96E29 417 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PYURFQ96I23 114 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 IGSF21Q96ID5 467 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF583Q96ND8 569 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF558Q96NG5 402 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 OR52E6Q96RD3 313 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZNF347Q96SE7 839 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SLC29A1Q99808 456 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 RACGAP1Q9H0H5 632 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ACTR8Q9H981 624 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 PIDD1Q9HB75 910 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TM9SF3Q9HD45 589 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 HMG20AQ9NP66 347 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ATAD3AQ9NVI7 634 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SMOXQ9NWM0 555 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 SPG21Q9NZD8 308 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 LHX3Q9UBR4 397 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 FAM8A1Q9UBU6 413 aa4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
AC024909.1-201ENST00000549278 LIMD1Q9UGP4 676 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms