RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SLC32A1Q9H598 525 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GFYI3L273 518 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 QSOX1O00391 747 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ULK1O75385 1050 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ADH1BP00325 375 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ACADMP11310 421 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CDK3Q00526 305 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PLIN5Q00G26 463 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NEK5Q6P3R8 708 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 Q6ZSR9 355 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 Q7L0L9 218 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RNF175Q8N4F7 328 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CDRT15Q96T59 188 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ASF1AQ9Y294 204 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CA5BQ9Y2D0 317 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 A0A088AWK7 358 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 AXIN1O15169 862 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CATP04040 527 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SLC2A4P14672 509 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SOX11P35716 441 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 GGT5P36269 586 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TFF2Q03403 129 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 DPTQ07507 201 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ENPP2Q13822 863 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 SQLEQ14534 574 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 IRF4Q15306 451 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 IMPG1Q17R60 797 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CHSY3Q70JA7 882 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 HMGB4Q8WW32 186 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 VPS33AQ96AX1 596 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TEX37Q96LM6 180 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RTKNQ9BST9 563 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 RDH14Q9HBH5 336 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TMCO1Q9UM00 188 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-215ENST00000549143 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
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CS-215ENST00000549143 SLC5A10A0PJK1 596 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CIB2O75838 187 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CLDN2P57739 230 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 GBX1Q14549 363 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SUSD1Q6UWL2 747 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 Q6ZS52 159 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 AMZ2Q86W34 360 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 MIER2Q8N344 545 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SFRP1Q8N474 314 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PKP4Q99569 1192 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 C1orf21Q9H246 121 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 WDR41Q9HAD4 459 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ADA2Q9NZK5 511 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 H0Y8X5 98 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 MATN4O95460 622 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CLDN9O95484 217 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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CS-215ENST00000549143 EPORP19235 508 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ACSL1P33121 698 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ADPRHP54922 357 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 UFM1P61960 85 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PPP2CBP62714 309 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PPP2CAP67775 309 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 IRF8Q02556 426 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CHIT1Q13231 466 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 XKR6Q5GH73 641 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 AGTRAPQ6RW13 159 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 NLRP8Q86W28 1048 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 FUNDC1Q8IVP5 155 aa8.21□□□□□ -1.1
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