RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 PTPN5P54829 565 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CYP4F2P78329 520 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 REP15Q6BDI9 236 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MAPK15Q8TD08 544 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 APOLD1Q96LR9 279 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NECTIN4Q96NY8 510 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LAMB2P55268 1798 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF726A6NNF4 738 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ABLIM1O14639 778 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RGS10O43665 173 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TIPRLO75663 272 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CD2P06729 351 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ACVR2AP27037 513 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 UGT1A3P35503 534 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ABCG1P45844 678 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GBE1Q04446 702 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DGCR6Q14129 220 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SEMA3AQ14563 771 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SMU1Q2TAY7 513 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SNX33Q8WV41 574 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NPAS2Q99743 824 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TDP1Q9NUW8 608 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CASKO14936 926 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 GSC2O15499 205 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DHFRP00374 187 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 WASP42768 502 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SUOXP51687 545 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MPP1Q00013 466 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC25A3Q00325 362 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NFKB2Q00653 900 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SP140Q13342 867 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 COLEC12Q5KU26 742 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM110Q86TL2 294 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ANKFN1Q8N957 763 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 THRSPQ92748 146 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CD84Q9UIB8 345 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 DMTF1Q9Y222 760 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FOLH1Q04609 750 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LIPEQ05469 1076 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 FOXM1Q08050 763 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SLC34A3Q8N130 599 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SIX5Q8N196 739 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CPT1BQ92523 772 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 MOAP1Q96BY2 351 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf74Q96LT6 269 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CHP2O43745 196 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 AP2A2O94973 939 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CCNB2O95067 398 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LATS1O95835 1130 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 SOD2P04179 222 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 CFIP05156 583 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ALOX5P09917 674 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 LMO2P25791 158 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-226ENST00000546160 ACTR1BP42025 376 aa6.28□□□□□ -1.4
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