RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-222	ENST00000532751	XKR8	Q9H6D3	395 aa		21.31	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		21.31	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		21.31	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		21.31	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	POMT2	Q9UKY4	750 aa		21.31	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ICK	Q9UPZ9	632 aa		21.31	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ADAMTS20	P59510	1910 aa		21.31	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	C2orf74	A8MZ97	194 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	BTN3A3	O00478	584 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	VPS26A	O75436	327 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	CDH3	P22223	829 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	CLCN7	P51798	805 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	FOXM1	Q08050	763 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	GBX1	Q14549	363 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	PALM2	Q8IXS6	379 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		21.3	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	PIPSL	A2A3N6	862 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	CCNF	P41002	786 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ABCG1	P45844	678 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC7A5	Q01650	507 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	MGAT5	Q09328	741 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	KYNU	Q16719	465 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKS6	Q68DC2	871 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	INPP5D	Q92835	1189 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ZFAT	Q9P243	1243 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	GALP	Q9UBC7	116 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	AHSG	P02765	367 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	LIPC	P11150	499 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	RAB28	P51157	221 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	BROX	Q5VW32	411 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	GPR21	Q99679	349 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	CTRC	Q99895	268 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	DHRS7	Q9Y394	339 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	NFS1	Q9Y697	457 aa		21.28	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SDK2	Q58EX2	2172 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	STMND1	H3BQB6	276 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	KLK10	O43240	276 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	MAP3K7	O43318	606 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	PKLR	P30613	574 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SH3BP2	P78314	561 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	HSD11B2	P80365	405 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ACY1	Q03154	408 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	CEP112	Q8N8E3	955 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	PMEPA1	Q969W9	287 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	OR6C1	Q96RD1	312 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	NRTN	Q99748	197 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	MED16	Q9Y2X0	877 aa		21.27	■■□□□ 1
PTPRK-222	ENST00000532751	MATN4	O95460	622 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PTPRK-222	ENST00000532751	C1orf105	O95561	183 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PTPRK-222	ENST00000532751	TPBGL	P0DKB5	382 aa		21.26	■□□□□ 0.99

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