RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520177.5

G3BP1-208, Transcript of G3BP stress granule assembly factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene G3BP1, Length 2,700 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1-208ENST00000520177 SVOPQ8N4V2 548 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 RASSF1Q9NS23 344 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 PATJQ8NI35 1801 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 IQCF5A8MTL0 148 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 H0Y626 953 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 FFAR3O14843 346 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 GPR42O15529 346 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 TSPAN3O60637 253 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 TRIM16O95361 564 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 PGRP06401 933 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 RETP07949 1114 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 TGFBR2P37173 567 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 DAPP51397 102 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 IL10RBQ08334 325 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 SYT16Q17RD7 645 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 LACC1Q8IV20 430 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 CD200R1Q8TD46 325 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 RMDN1Q96DB5 314 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 DPY30Q9C005 99 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.6□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 ASNA1O43681 348 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 SERPINF2P08697 491 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 OR4Q2P0C623 313 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 BMPR1AP36894 532 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 HMGCS1Q01581 520 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 SERINC3Q13530 473 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 C17orf50Q8WW18 174 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 SLC39A13Q96H72 371 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 OPTCQ9UBM4 332 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 GPR182O15218 404 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 DIRAS1O95057 198 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 TBX18O95935 607 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 POMCP01189 267 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 HMBSP08397 361 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 NRIP1P48552 1158 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 EFEMP1Q12805 493 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 GTF2H2Q13888 395 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 AHSA2Q719I0 299 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 LIX1Q8N485 282 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 PYURFQ96I23 114 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 OR52E6Q96RD3 313 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 MAGIXQ9H6Y5 334 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 IPPKQ9H8X2 491 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 IL37Q9NZH6 218 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.59□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 EPOP01588 193 aa14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 OR1E1P30953 314 aa14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 PHC1P78364 1004 aa14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 ZNF404Q494X3 552 aa14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 SGO1Q5FBB7 561 aa14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 TINF2Q9BSI4 451 aa14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.58□□□□□ -0.07
G3BP1-208ENST00000520177 A0A0U1RQS6 177 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-208ENST00000520177 ISPDA4D126 451 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-208ENST00000520177 E5RI56 91 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-208ENST00000520177 F8W810 466 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-208ENST00000520177 ZNF682O95780 498 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-208ENST00000520177 KRT20P35900 424 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-208ENST00000520177 PSEN2P49810 448 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-208ENST00000520177 TRAF3Q13114 568 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-208ENST00000520177 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.58□□□□□ -0.08
G3BP1-208ENST00000520177 DESI1Q6ICB0 168 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.9 ms