RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518885.1

CNOT7-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 3

Gene CNOT7, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-204	ENST00000518885	CES3	Q6UWW8	571 aa		23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	CALML6	Q8TD86	181 aa		23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	MED8	Q96G25	268 aa		23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	XKR8	Q9H6D3	395 aa		23.43	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	C21orf140	B9A014	251 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF185	O15231	689 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	SCRG1	O75711	98 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	DLST	P36957	453 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	RAB28	P51157	221 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	KIR2DS3	Q14952	304 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	BORA	Q6PGQ7	559 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	SEC14L1	Q92503	715 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	SLCO2A1	Q92959	643 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM117A	Q9C073	453 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	ATM	Q13315	3056 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		23.42	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	KALRN	O60229	2985 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	CTAGE9	A4FU28	777 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	IQCF5	A8MTL0	148 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885		E5RI56	91 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	TCN2	P20062	427 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	ARNT	P27540	789 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	CCNF	P41002	786 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	PAFAH1B1	P43034	410 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	GPR19	Q15760	415 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	PCSK4	Q6UW60	755 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	KRT222	Q8N1A0	295 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	STARD8	Q92502	1023 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	LPGAT1	Q92604	370 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	EXTL1	Q92935	676 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	TCTN2	Q96GX1	697 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	RNF14	Q9UBS8	474 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	CROT	Q9UKG9	612 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	CDYL	Q9Y232	598 aa		23.41	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	USP1	O94782	785 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	CYP2A7	P20853	494 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	FMO4	P31512	558 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	ABR	Q12979	859 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	PTK6	Q13882	451 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	TBR1	Q16650	682 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	LONRF1	Q17RB8	773 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM135	Q86UB9	458 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	NAT9	Q9BTE0	207 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	LHX9	Q9NQ69	397 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		23.4	■■□□□ 1.34
CNOT7-204	ENST00000518885		A0A0J9YY10	115 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	ISM1	B1AKI9	464 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	SMAP	O00193	183 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	HBQ1	P09105	142 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	ST6GAL1	P15907	406 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	UGT2B7	P16662	529 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	CHRM3	P20309	590 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	ATP5D	P30049	168 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	KYNU	Q16719	465 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	GPR135	Q8IZ08	494 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	LRFN5	Q96NI6	719 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	GPR87	Q9BY21	358 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		23.39	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	USP27X	A6NNY8	438 aa		23.38	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		23.38	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	23.38	■■□□□ 1.33
CNOT7-204	ENST00000518885	TTC4	O95801	387 aa		23.38	■■□□□ 1.33

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