RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 RRN3P2A6NIE6 340 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PI4K2BG5E9Z4 385 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 AVILO75366 819 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 HPP00738 406 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHEP01854 428 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACTN1P12814 892 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL21P46778 160 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 B3GALT5-AS1P59052 145 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD300CQ08708 224 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCHO2Q0JRZ9 810 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FHL5Q5TD97 284 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM207Q6UWW9 146 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 VITQ6UXI7 678 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF841Q6ZN19 808 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAPH1Q70E73 1250 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEACAM19Q7Z692 300 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADCK1Q86TW2 530 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSPYL6Q8N831 410 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUMF1Q8NBK3 374 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ELMOD3Q96FG2 381 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZIM3Q96PE6 472 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC22A12Q96S37 553 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 VN1R1Q9GZP7 353 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDCL3Q9H2J4 239 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 RRN3Q9NYV6 651 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 POMT2Q9UKY4 750 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 VSIG4Q9Y279 399 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 COMMD10Q9Y6G5 202 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNE2Q9Y6J6 123 aa2.19□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PR80 420 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCNDBP1O95273 360 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 LBX1P52954 281 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CES4AQ5XG92 561 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFAP206Q8IYR0 622 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCLT1Q96NL6 688 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FNBP1Q96RU3 617 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NCAPGQ9BPX3 1015 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPCSQ9HAB8 311 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGF21Q9NSA1 209 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SETD4Q9NVD3 440 aa2.18□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 HYKKA2RU49 373 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SHISA9B4DS77 424 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 EPHB6O15197 1021 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 POP4O95707 220 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV4-31P0DP07 118 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCL3P20749 454 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GUCY2DQ02846 1103 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 BIRC2Q13490 618 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINGO4Q6UY18 593 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM64Q6YI46 380 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHMP1BQ7LBR1 199 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM139Q8IV31 216 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 EID3Q8N140 333 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR13C3Q8NGS6 347 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ETNPPLQ8TBG4 499 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPRL2Q8WTW4 380 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZUFSPQ96AP4 578 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1orf74Q96LT6 269 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS6KC1Q96S38 1066 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSMB7Q99436 277 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 NYAP2Q9P242 653 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNNQ9UQP3 1299 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTMR6Q9Y217 621 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFECO14948 347 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEC24AO95486 1093 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 BSGP35613 385 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCGF3Q3KNV8 242 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRTP1Q5TC63 336 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCN1P1Q5VSP4 162 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACAD10Q6JQN1 1059 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-277P-201ENST00000516272 FRRS1Q6ZNA5 592 aa2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms