RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 EQTNQ9NQ60 294 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ABCB8Q9NUT2 735 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 OLAHQ9NV23 265 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HPF1Q9NWY4 346 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MIOSQ9NXC5 875 aa4.74□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PS18 150 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CTAGE9A4FU28 777 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 OR6C76A6NM76 312 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 STAM2O75886 525 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PDE9AO76083 593 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 LINGO3P0C6S8 592 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CTAGE8P0CG41 777 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 P4HA1P13674 534 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GAP43P17677 238 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 DNASE1P24855 282 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TROAPQ12815 778 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PPA1Q15181 289 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 KLC3Q6P597 504 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PLXDC2Q6UX71 529 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PACS1Q6VY07 963 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 EXOC3L1Q86VI1 746 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 NLRP14Q86W24 1093 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MFN1Q8IWA4 741 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SYCP3Q8IZU3 236 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 XXYLT1Q8NBI6 393 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PSMA8Q8TAA3 256 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SEMA4DQ92854 862 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 LINGO1Q96FE5 620 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ABCG4Q9H172 646 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TNMDQ9H2S6 317 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MID1IP1Q9NPA3 183 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 RHCGQ9UBD6 479 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 NME7Q9Y5B8 376 aa4.73□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 A0A0G2JNG1 304 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ELOVL7A1L3X0 281 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 A4D1N5 150 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 KRT87PA6NCN2 255 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 C5orf60A6NFR6 353 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PRAC2D3DTV9 90 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 DNM1LO00429 736 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 XRCC3O43542 346 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SLC22A3O75751 556 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GCNT3O95395 438 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 C22orf31O95567 290 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SLC4A1P02730 911 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TFAP2AP05549 437 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 KRT19P08727 400 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CSF2RAP15509 400 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CASTP20810 708 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HSPA4P34932 840 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MTHFRP42898 656 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MMP15P51511 669 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 IL1RL1Q01638 556 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HSPB3Q12988 150 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GAGE5Q13069 117 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 GAGE6Q13070 117 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 RPA4Q13156 261 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 KIR2DS5Q14953 304 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ASPRV1Q53RT3 343 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SFMBT2Q5VUG0 894 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 NUP54Q7Z3B4 507 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 LONP2Q86WA8 852 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 PTOV1Q86YD1 416 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 ZNF595Q8IYB9 648 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 FIBINQ8TAL6 211 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 MR1Q95460 341 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 HES6Q96HZ4 224 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 OLFM1Q99784 485 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 WNT5BQ9H1J7 359 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 DPAGT1Q9H3H5 408 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 TRPC7Q9HCX4 862 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 STK26Q9P289 416 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 LIPT1Q9Y234 373 aa4.72□□□□□ -1.65
CCL20-204ENST00000489160 A0A0B4J293 547 aa4.71□□□□□ -1.66
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