RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 AIREO43918 545 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 DNTTP04053 509 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CAP1Q01518 475 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PRKG2Q13237 762 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 COQ5Q5HYK3 327 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ATAD1Q8NBU5 361 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 OR2T12Q8NG77 320 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ESAMQ96AP7 390 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZIC5Q96T25 663 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SLC52A3Q9NQ40 469 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 OPTCQ9UBM4 332 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RGS10O43665 173 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ICMTO60725 284 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ALX3O95076 343 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 MED26O95402 600 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PRSS56P0CW18 603 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 IFNA8P32881 189 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NKG7Q16617 165 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SMU1Q2TAY7 513 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SLX4IPQ5VYV7 408 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RAP1GAP2Q684P5 730 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 AHSA2Q719I0 299 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 IFNL1Q8IU54 200 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZNF683Q8IZ20 524 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 OR8H2Q8N162 312 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PARP16Q8N5Y8 322 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TP53INP1Q96A56 240 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 MMP27Q9H306 513 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SCO2O43819 266 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 KATNA1O75449 491 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 FGF4P08620 206 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PFKLP17858 780 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 MASP1P48740 699 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 GTF2H3Q13889 308 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZNF544Q6NX49 715 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ADHFE1Q8IWW8 467 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CADM2Q8N3J6 435 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 BCL7BQ9BQE9 202 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 BTBD2Q9BX70 525 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A51Q9H1U9 297 aa13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 MYO1GB0I1T2 1018 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 AP3D1O14617 1153 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TFECO14948 347 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 AREL1O15033 823 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NDST3O95803 873 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ARPP19P56211 112 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RBBP7Q16576 425 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHG6Q3KR16 790 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SIRPB2Q5JXA9 342 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SIGIRRQ6IA17 410 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 AMER2Q8N7J2 671 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 OR6F1Q8NGZ6 308 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SOCS4Q8WXH5 440 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ASB2Q96Q27 587 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SH3GL1Q99961 368 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 AIG1Q9NVV5 245 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 EHD3Q9NZN3 535 aa13.21□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 MUSKO15146 869 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTS4O75173 837 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 PRSS23O95084 383 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 IGFBP5P24593 272 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CD6P30203 668 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ACVRL1P37023 503 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 DCTP40126 519 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 OR1G1P47890 313 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 TBX4P57082 545 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 AAK1Q2M2I8 961 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CLLU1OSQ5K130 101 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 MARC1Q5VT66 337 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 KANK2Q63ZY3 851 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SPATA19Q7Z5L4 167 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 CILP2Q8IUL8 1156 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 ELMOD2Q8IZ81 293 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 NLGN4XQ8N0W4 816 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 IL17RDQ8NFM7 739 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SLC39A13Q96H72 371 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 SERPINB11Q96P15 392 aa13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
NISCH-212ENST00000488380 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms